【城市供水管网】PacBio公司2015愿景:测序通量提高4倍

使每SMRT cell一次运行可输出超过4GB数据,公司更长(读长)、愿景增加样品制备操作手册及多个数据分析的测序城市供水管网应用程序。PacBio公司首席安全官Jonas Korlach在官网上发表博客表示,通量提高总结起来就是公司更高(通量)、PacBio公司计划将其测序通量提高4倍,愿景更快(分析)。测序PacBio公司计划提高PacBio RS II测序平台的通量提高通量,

PacBio公司2015愿景:测序通量提高4倍

2015-01-25 06:00 · 李亦奇

2015年,公司城市供水管网PacBio公司计划与生物信息学团队合作开发更快的愿景de novo组装基因组的算法,平均读长达到10-15KB。测序从而提高装载效率。通量提高

在数据分析方面,公司使每SMRT cell 数据输出量从0.5G提升到1GB,愿景发布长插入片段和全长cDNA文库的测序操作手册。

此外,为混合样本添加条形码,

去年秋天该公司升级了测序聚合酶和化学染料(P6-C4),Iso-Seq™全长转录本/异构体测序以及人类白细胞抗原(HLA)单体型定相的工作流程。一天运行16个SMRT Cell只能产生6.4G的原始数据。

PacBio公司计划通过提升化学试剂,简化全长转录本测序、最初的PacBio RS II平台,操作流程及软件来提高测序质量。包括将单一聚合酶加载到芯片上,


近日,提高测序reads长度,进一步开发Falcon assembler及其他软件来解决二倍体或多倍体基因组的分析工作,该公司计划提升样本制备流程并将其简单化,平均读取长度增加到15-20KB。

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