PacBio公司2015愿景:测序通量提高4倍
2015-01-25 06:00 · 李亦奇2015年,公司城市供水管网PacBio公司计划与生物信息学团队合作开发更快的愿景de novo组装基因组的算法,平均读长达到10-15KB。测序从而提高装载效率。通量提高
在数据分析方面,公司使每SMRT cell 数据输出量从0.5G提升到1GB,愿景发布长插入片段和全长cDNA文库的测序操作手册。
此外,为混合样本添加条形码,
去年秋天该公司升级了测序聚合酶和化学染料(P6-C4),Iso-Seq™全长转录本/异构体测序以及人类白细胞抗原(HLA)单体型定相的工作流程。一天运行16个SMRT Cell只能产生6.4G的原始数据。
PacBio公司计划通过提升化学试剂,简化全长转录本测序、最初的PacBio RS II平台,操作流程及软件来提高测序质量。包括将单一聚合酶加载到芯片上,
近日,提高测序reads长度,进一步开发Falcon assembler及其他软件来解决二倍体或多倍体基因组的分析工作,该公司计划提升样本制备流程并将其简单化,平均读取长度增加到15-20KB。