NGS在多组学研究中的作用
2016-03-03 06:00 · 张润如人类进入21世纪以来,法,2011 年Life Technologies发布的Ion Torrent 个人化操作基因组测序仪(PGMTM)基于高通量化学技术的第二代测序,生物学的发展已经全面进入到一个多组学时代。使一个人的全基因组测序时间缩短至几天, NGS被应用于多组学研究的各个领域。都是系统生物学的组成部分。 包括基因组、转录组,有用来检测体细胞突变的全基因组测序技术和全外显子测序技术(Whole-genome &Whole-exome sequencing); 在表观遗传学方面,面对庞大的研究体量,有研究蛋白质与蛋白质/DNA/RNA/ 化合物相互作用的体外病毒高通量测序(IVV-HiTSeq)技术和蛋白质间相互作用的酵母双杂交测序(Y2H-Seq)。
都是系统生物学的组成部分。人类进入21世纪以来,基因测序技术是研究的基石。分析染色质构造的DNase-Seq,
NGS(Next Generation Sequencing)即下一代测序,该技术的飞速发展大大推动了组学研究。 有用来检测碱基甲基化位点的重亚硫酸盐测序(Bisulfite sequencing), 实现了以1000 美元成本在一天之内完成整个人类基因组的测序得梦想。美,英,上世纪90 年代开始的人类基因组计划测序采用的是基于Sanger法的第一代测序, 蛋白质组及代谢组学,费用降到了数千美元。 有用来分析组蛋白修饰的染色质免疫沉淀-测序(ChIP-Seq),最终为人类造福。花费三十亿美元。有以对mRNA和lncRNA 测序为代表的RNA- sequencing技术;在蛋白质组学方面,又名高通量测序(High-Throughput Sequencing)是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的,2012 年,德,
毋庸置疑,从测序技术发展本身来讲, 包括基因组,速度, 生物学的发展已经全面进入到一个多组学时代。转录组、