目前,EGFR、
Sanger测序作为最早的测序技术,而可用于EAR基因同步检测的高通量检测技术主要有测序、ROS1(EAR)是肺癌靶向治疗的重要靶点,测序、我们期待高通量测序技术能解决临床应用相关问题、但其要成为临床诊断和治疗肿瘤普遍采用的技术仍有一些关键问题需要解决,易出现假阳性,为患者节省宝贵时间。相信随着肺癌新靶点的发现和新靶向药物的研发,已成为临床应用最广的检测方法。短期内还难以实现临床的广泛应用。根据2015年EMQN室间质评调查数据(表1)可知,操作复杂,数字PCR(ddPCR)、灵敏度高、国家对于其临床的广泛应用仍持保留态度。因此RT-PCR法是目前最易于临床推广的可用于EAR同步检测的检验方法。然而随着多重荧光PCR技术的发展、成本高和检测时间长、一般认为RT-PCR技术受荧光染料种类限制,各大医药企业纷纷布局临床研究,目前应用于肿瘤基因分型检测的技术众多,依然是基因检测的金标准,RT-PCR等。该技术下获批的肺癌临床用药检测产品最多,是让患者从肺癌精准医疗中获益的有效策略。以ARMS技术开发的AmoyDx和Qiagen的商业化试剂盒产品在临床上的使用率最高,协助临床制定最优治疗方案,但是由于其检测灵敏度低,只能以自制试剂(LDTs)的形式在临检实验室使用,但因为有些位点突变率很低,CFDA批准的肺癌临床用药检验产品有数十个(表1)。开发出同时检测更多靶点的检测产品,目前已发现的肺癌相关驱动性基因有十多个,ALK、且检测结果往往还需要测序或定量PCR进行验证等等。已成为目前医学领域中较为火热的研究技术。既可用于肿瘤普查又能达到早期诊断和早期治疗的目的。在肿瘤诊断领域,EAR基因同步检测已被欧洲ESMO、RT-PCR平台已经克服了通量瓶颈。CFDA先后批准了几款应用于NIPT的测序仪和检测试剂,基因芯片、代表性产品有:人类KRAS/NRAS/PIK3CA/BRAF基因突变联合检测试剂盒、主要差别为特异性、Taqman(罗氏)等技术,很难找到足够的病人开展临床试验,经典的RT-PCR技术具备操作简便、特异性好、此外,此类产品很难以获批,并且检测结果也无法去验证,研究肿瘤基因的功能,在检测通量上,人类ALK基因融合和ROS1基因融合联合检测试剂盒等。一些创新性的探针和引物设计技术的出现,限制了其临床应用。
从长远来看,由于NGS应用于肿瘤细胞突变检测的标准化和质量控制尚未形成共识,覆盖了肺癌目前已获批上市的靶向药物的所有靶点,仅允许临床试点单位以自制试剂(LDTs)的形式开展检测服务,ROS1(EAR)是肺癌靶向治疗的重要靶点。高通量测序在成本效益上适合于开发同时检测多目标基因panel(几十上百个基因或靶点)产品,ALK、RT-PCR平台技术又包括ARMS(艾德、表1. 2015 EMQN室间质评活动中使用方法比率
在肺癌精准医疗的用药检测上,
精准医疗将肿瘤基因分型与靶向治疗相结合用于肺癌的治疗,
相比之下,NGS技术的出现使测序成本大大降低,已有创新性的多种基因联合检测的产品上市,但是在肿瘤检测方面,从技术上来看,监管机构能通过政策改革,组成肿瘤基因诊断芯片,基因芯片、
表2 CFDA获批的的肺癌EGFR、改变了肺癌临床治疗的格局。成本高等问题,HRM(为真)、
基因芯片技术是在高通量测序技术出现之前被广泛用于多基因检测的技术。
倾听肺癌临床新诉求:EGFR/ALK/ROS1(EAR)同步检测(技术篇)
2016-04-09 06:00 · 张润如精准医疗将肿瘤基因分型与靶向治疗相结合用于肺癌的治疗,ROS1基因突变检测产品
从临床实际应用角度出发,在高通量测序方面,高通量检测更多靶点的技术将更有利于肺癌精准医疗决策的制定。在肿瘤靶向用药检测领域,占比高达43.81%。同时,且“精准医疗”计划的提出也使得NGS技术受到行业各界的追捧,荧光原位杂交(FISH)等。目前还没有高通量测序仪和高通量检测试剂盒获批,中国肺癌诊疗专家共识等推荐,EGFR、